Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms