Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms