Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms