Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms