Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf109Q9NX04 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms