Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms