Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms