Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms