Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms