Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC31BQ9NQW1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms