Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FSCN3Q9NQT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FSCN3Q9NQT6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms