Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms