Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L4AQ9HCS5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms