Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms