Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLMPQ9H6B4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms