Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF41Q9H4P4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms