Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms