Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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