Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms