Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM55Q9BYV6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms