Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms