Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms