Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms