Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms