Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM29Q9BSF4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms