Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FYCO1Q9BQS8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms