Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK3Q9BQ16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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