Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EYA3Q99504 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms