Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF2Q99496 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms