Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRNP1Q96S65 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms