Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP6Q96RT7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP6Q96RT7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms