Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms