Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms