Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms