Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRIQ1Q96JM4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
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