Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF2Q96GP6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms