Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms