Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC1Q96C34 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms