Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms