Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM52Q96A61 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM52Q96A61 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms