Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms