Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP4Q969X6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms