Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR2Q969E8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms