Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms