Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms