Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms