Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms