Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RHBDD1Q8TEB9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms