Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSH3Q8TE77 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms