Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-3Q8TAU0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms